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O Centro de Investigação em Ciência Política está organizado em quatro grupos de investigação: (i) Administração e Políticas Públicas; (ii) Governação e Democracia; (iii) Estados, Organizações Internacionais e Desafios nas Relações Internacionais Contemporâneas; (iv) Sociedade, Europa e Dinâmica Global. Está atualmente classificado como Excelente na área da Ciência Política pela FCT.
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O Núcleo de Investigação em Políticas Económicas e Empresariais está organizado em cinco linhas de investigação: (i) Economia Política e Macroeconomia ; (ii) Economia Industrial, Regional e Ambiental; (iii) Economia do Trabalho e Métodos Quantitativos; (iv) Finanças e (v) Gestão. O NIPE está classificado em segundo lugar entre os centros de investigação portugueses na área da Economia, tendo obtido a classificação de Muito Bom na última avaliação efetuada pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia.
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